据模拟动画显示，才确定长江口二号古船是不是木质帆船，是哪个年代的帆船。
其他还有所在水域的水深，船体埋藏的深度，周围的环境等等。
最终得到确切数据，古船残长约385米、残宽约78米，已探明有31个舱室。
沉船上部的尖艏、揽桩、主桅杆、左右舷、上甲板等结构完整。
考古人员通过选取前后其中4个舱室，进行了小范围清理，均发现舱内有码放整齐的景镇窑瓷器等精美文物。
另外，在船体及周围还出土了紫砂器、南越产水烟罐、木质水桶残件等。
除此之外，还有船上的一些东西，比如桅杆、大型硬木船材、铁锚、棕缆绳、滑轮、金属钻头、钻杆以及黑色矿物等大量文物。
2021年7月至9月，大海市文物局再次组织水下考古专业机构，对长江口二号古船及周围进行了水下调查。
他们清理出，前几次调查未发现的元代瓷器，和60厘米高完整的豆青釉青花大瓶等大型瓷器。
特别是古船中部分出水瓷器底书“同治年制”款，为古船的断代提供了重要的依据。
清代的沉船，上面还有外国货，那么他到底是进口的船，还是出口的船？
最重要的是，这艘船上还有一些元青花，特别是其中还有一件六十厘米高的青花大瓶，这就比较有意思了。
这样一来，之前陈文哲打捞的清代沉船，发现宋代、元代瓷器，也算是再正常不过了。
不过，在查看这艘沉船打捞出水的过程，还是让陈文哲有点惊讶。
因为他发现，在这长江口打捞沉船，一点也不比在海上打捞沉船来的轻松。
由于长江口二号古船，受水流冲刷严重，特别是随着长江口水势流向改变，河床由淤积转变为快速下切，致使古船加速露出河床表面。
这样一来，船体面临严重安全威胁，这也给打捞带来了很大的挑战。
目前全球水下沉船考古的打捞方式，主要有三种。
第一种提取船上文物后，拆解打捞沉船。
第二是采用围堰抽水，进行考古发掘后再打捞沉船。
最后一种是使用特制沉箱，将沉船、文物与其周围海水、泥沙，按照原状，一次性吊浮起运整体打捞。
当时，为防止长江口二号古船遭到自然与人为破坏，专家建议需尽快打捞出水，并移入固定场所进行考古发掘、文物保护、研究及展示利用。
由于长江口水体浊度极高，水下能见度几乎为零，平潮工作时间又很短，无法完成科学的水下考古测绘、拍照作业。
同时，水下考古和建造围堰所需时间和成本巨大，围堰后考古还将长时期阻碍航道。
因此，大海市文物局在听取专家意见，评估沉船面临的风险，综合分析三种考古和保护方式后，决定对长江口二号古船采取整体打捞的方式。
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【我的系统不正经】【】
而整体打捞能以最短时间、最小成本、最大程度保留历史信息迁移沉船。
打捞方式确定了，打捞方法也至关重要。
当时的工作人员，针对长江口泥沙含量高，且水流速度快，及古船及其周围环境的特殊性，专门设计了打捞方法。
负责这次古船打捞任务的专家，决定采用世界上前所未有的创新方案——弧形梁非接触文物整体迁移技术，来打捞这艘古代沉船。