尽管若林雅乐助、若林家吉、洲崎兵库等人在收拢败军之后，还发起反击讨取上杉军一员大将长尾景连，并击退黑川清实部的追击，但是对于加贺整体的战局来说并没有起到丝毫的作用。
在迫于上杉军的巨大压力之下，洲崎兵库甚至不得不主动放弃位于朝日山城南面的居城松根城，与若林雅乐助、若林家吉等人一同进入梨木城进行固守。
而原先包围尾山御坊的超胜寺实显、光德寺乘贤、下间寿法等人也纷纷撤围退守本泉寺、传灯寺等易守难攻之处。
这下超胜寺实显、光德寺乘贤、下间寿法等人就坑惨了下间赖照所率的五千余军势，他们一后撤就使得下间赖照所部孤立无援起来，随时都有陷入上杉军的包围之中。
上杉辉虎在朝日山城一带站稳脚跟后，就察觉到了一向一揆军的破绽，当即联同倒向上杉家一方的七里赖周、藤丸胜俊、龟田宗俊等将出兵切断了下间赖照所部的退路，并准备与材木川北岸的柿崎景家等将对这支一向一揆军孤军围歼。
然而下间赖照所率的这支一向一揆军仅有五千余人，哪里是近三万之众的上杉军对手，如今的一向一揆军已经被上杉军团团围住，柿崎景家在北、七里赖周在西南、上杉辉虎在东南、西面为大海。下间赖照被迫在材木川南岸摆下圆阵，将青壮、僧兵布置在最外围，老弱妇孺在中间。
可还没等下间赖照将圆阵布置完，上杉军就从三个方向同时对一向一揆军发起了勐攻。数万人混在一起，短兵相接，互相搏杀。两军鏖战多时，尘埃更是在漫天飞舞着。
柿崎景家、神保长职、黑川清实、色部胜长等将更是亲率麾下骑马武士，环绕着以步卒为主的一向一揆军，疯狂地向他们发起冲击，很快就将圆阵冲出了几个大缺口，一向一揆军也瞬间被冲散了。
下间赖照可不愿坐以待毙，他见势不妙，立即带着几名僧兵突围至海边，并寻得一条渔船。他随即做出了一个非常惊人的决定——抛弃还在奋战的一向一揆众，独自逃离。
随着下间赖照逃离战场后，一向一揆军就失去了主心骨，等待着他们的完全是一场单方面的屠杀。
一向一揆军根本抵挡不住上杉军的凌厉攻势，没多久就失去了战意，四散溃逃。而上杉军则是不断缩小着包围圈，五千余一向一揆军，不是被讨取，就是在材木川中溺毙，就连龟田宗俊、柴山长次郎等国人领主也都跑来凑个热闹，突袭正在溃散的一向一揆军，成功讨取了不少人。从材木川南岸至尾山御坊，沿途到处都是尸体。
二曲右京进、永山治郎、镝木勘解由等北加贺一向一揆众有力武将们也是先后被上杉军所讨取，此战之后，加贺一向一揆众在北加贺两郡的势力可谓是被上杉家连根拔起。
位于河北郡和石川郡中规模较大一些的加贺一向宗寺院，如迎西寺、专光寺、善福寺、圣安寺、广济寺等也在随后被上杉军尽数捣毁，佛像则是被尽数运往越后本誓寺。
之后，一向宗门徒众在恐惧之下，大都选择望风投降上杉军。
辉虎自然不可能就此放过加贺一向一揆众，在材木川之战获得大胜后，她就以七里赖周、藤丸胜俊、龟田宗俊等人为先导役，辅左担任先阵的山本寺定长，继续向西攻打加贺一向一揆众的残余势力。
而辉虎自己则是率上杉军主力攻打固守在本泉寺、传灯寺、梨木城等地的超胜寺实显、若林雅乐助、光德寺乘贤、洲崎兵库等人。同时，辉虎还令中条藤资、黑川清实、色部胜长等将率五千余军势攻打梨木城。
天文二十三年，十一月三十日。
辉虎与景定二人率一万八千余军势兵临传灯寺外，直接将传灯寺外的坊社焚毁一空。固守在寺内的堀才之助自知不敌，当即弃城而逃。
就这样上杉军便兵不血刃的夺取了传灯寺，并将梨木城与本泉寺之间的联系也切断了。